新冠病毒溯源之蝙蝠

背景:

2019年在中国武汉的新冠疫情,导致了非常严重的呼吸道疾病。在2020年1月16日,武汉华南海鲜市场最早出现的疫情已经导致了中国2761人的感染和80人的死亡,以及世界上十余个国家的33人的感染。感染的症状有发烧,咳嗽,肺炎等。病毒已经由最早的海鲜传染到人转变为了人和人之间的传播。新冠疫情带来了极大的损失,想要克服这个困难,知己知彼是最好的办法,病毒的溯源也就显得尤为重要。

病毒源头:

武汉病毒所石正丽老师通过对早期感染病人的样本中获得的病毒进行全基因测序,感染病人的新型冠状病毒之间的序列基本相同,并且和2003年爆发的SARS病毒具有79.6%的同源性。而且,还发现SARS-Cov2和蝙蝠的冠状病毒具有96%的同源性。这也就说明SARS-Cov2极有可能来自于蝙蝠,是由蝙蝠体内的冠状病毒演化而来。

不仅如此,之前的资料表明SARS-Cov病毒在历史上已经有过两次大爆发,SARS和中东呼吸综合征。研究者认为这种蝙蝠来源的冠状病毒有可能会导致另一次的疾病爆发。

研究者通过对从武汉金银潭医院获得的病人样本进行不同模板的PCR扩增,对新型冠状病毒的基因序列的87.1%的阅读区域和SARS-Cov进行对比,发现其中有79.6%的序列是有相似性的。对来自四个不同地区的病人的样本中获得的SARS-Cov2进行全基因序列对比发现他们有99.9%的相似性。另外,SARS-Cov2和SRARS-Cov的蛋白编码序列也有着极大地相似性,因此可以推断出,两种病毒都属于一个种,SARSs-Cov。

另外,在之前云南出现过的蝙蝠冠状病毒中发现的一种依赖RNA聚合酶的RNA的全序列分析表明,这种冠状病毒和2019SARS-Cov2病毒的基因具有极大地相似性。接着研究者对2019-nCoV, RaTG13, SARS-CoV 和蝙蝠的SARSr-CoVs进行分析表明,RaTG13的刺突蛋白和2019 SARS-Cov 2的序列最为相似,并且他们的是S基因比其他的病毒长。所有的这些证据都在显示新冠病毒极有可能来自于蝙蝠,进而感染到人类。

在实验室对蝙蝠来源的冠状病毒和新冠病毒进行测定,对SARS-Cov 2的S基因的受体结合区域做了qPCR检测,用特定的引物可以区分出2019 SARS-Cov2 和其他冠状病毒的区别。用蝙蝠来源的冠状病毒的抗体对2019 SARS-Cov进行ELISA实验,实验结果显示IgM和IgG的含量都是随着时间的延长而增加的,但是在感染后期,IgM的含量下降,IgG发挥主要免疫作用,都表明这是一种急性的疾病。

在对病毒的细胞培养的过程中发现,病毒可以被马血清中的抗体识别,这也为新冠病毒感染者的治疗提供了一种思路,但是对于人的血清抗体是否发生反应就需要更严格的实验来证实。

由于蝙蝠的冠状病毒和SARS-Cov都是用ACE2作为侵入细胞的受体,为了去证实ACE2是否也是2019 SARS-Cov 2 的识别受体,研究者用ACE 2基因突变型的细胞培养病毒,结果发现SARS-Cov 2也是利用ACE 2受体,并且不能利用其它冠状病毒的其它受体。另外,对已经康复的受感染人群的血清学分析表明,康复者的血清中含有病毒的抗体,可以很好地抑制病毒的活性,这也为感染病毒的治疗提供了一种新的方法。

最后,希望这次的疫情早日结束,大家的工作、生活都能够回到正轨。

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