对外生信教学

写在前面的

UNSGM项目今天刚刚结束，就开始赶紧进行对外教学了。其实录课已经录到第六节课了。但是这似乎是第三节的课后推文。看来我还得加快推文速度啊。虽然这段时间非常忙但是也算是有很多收获，尤其是在生物安全大数据分析上收获颇多。当然在对外生信教学上也收获颇多。至少现在我很明确如何教学生了。尤其是在入门教学方面。

第三节课都学啥呢

记得上节课教了如何在Linux使用for循环、while循环。也大概教了他如何转化sra数据到fastq数据。当然给他留了一个作业是找fastq-dump和fasterq-dump的区别。不过我测试后觉得fasterq-dump比fastq-dump快了不是一点啊。以后我打算用faster-dump了。这节课我教了他如何使用faster-dump去转化数据。转化完数据后当然就是先了解啥是Fastq文件格式了，再接下来就是做质控了。先教怎么安装FastQC，然后如何运行FastQC，最后是解读FastQC的质控报告。算是教的很细致了。正常中国学生应该不到30分钟就可以熟练掌握这部分内容。但是我留给了他两天时间去理解。确实没有基础还是理解的慢。毕竟如此细致的教学应该是找不到第二个了。

教学感慨

个人觉得他当堂学完课程后并没有去好好复习巩固。有机会我会post出他自己的实操练习课程。从他不熟练的结果来看确确实实是没有好好复习的。我也是比较无语，大老远从巴基斯坦卡拉奇跑过来学成这样。不过该教还是得教的，毕竟教会他我才可以给一带一路一个交代。这只能怪我这个老师教的不好。再次立个flag，一定让他回国后熟练操作基本宏基因组分析。

接下来咋教

是时候增加他的练习时间了。毕竟每天花1小时教学，1小时监督他的练习还是很浪费我的时间的。我两个小时能干很多事情，写几个程序，搞定一些数据，读几篇文献。就是太浪费时间，硕士开题报告都还没有搞。

写在后面的
最近我的宏基因组与生物安全系列开始了，如果对这方面有兴趣的可以关注我在另一个公众号发的相关推文。

阅读原文