生信孔子学院(二)

对外生信教学

写在前面的

经过这几天教学,我发现我的教学方法确实是有效的。虽然Shs学的慢,但是他好歹还是逐渐学会了。不过说句心里话,对于巴基斯坦人来说能这样做科研已经很不错了。现在印巴关系紧张,巴基斯坦国力相对印度来说还是落后一大截。巴基斯坦国内的科研状况也不乐观。他们如此坚持学习,这种精神还是值得表扬的

第二节课都学啥呢

在我看来,直接带他操作实际项目还是很有成效的。所以第二节课,我简单问了问我给他留的作业后就开始了实际项目的操作。当然这个实际项目也是我自己随便找的。主要目的还是带他认识数据库、使用数据库。以及通过这个过程让他学会如何下载单个数据,再教他如何循环下载数据。由浅入深,我感觉他学的还行。不过跟我的中国学生比,他还是差了一大截。确实他们的抽象思维能力远远弱于中国人,很难找到一串有规律的字符串或者数字的特征规律。不过这个过程中带他熟悉了如何在Linux下使用for循环、while循环也是不错了。最后我教了他如何把下载的sra数据转化格式为fastq,教会了他如何看帮助文档。给了他一些作业。

我教的也很佛系

我之前教中国学生,还是要备课的,要讲啥,讲成什么样,哪里是重点。我还是自己先操作过。教Shs,我都没有事先操作演练过。这可能主要还是因为自己最近在做联合国项目很忙没空备课吧。其实另外一方面我也是在锻炼自己的临场发挥能力。反正录视频过程中除了下载数据、转格式我暂停过,其他时候我好想没有暂停过。带他做的项目也是,一开始我说为了节约时间就搞个16s数据吧,反正数据量小,下载快,转格式也快。结果实际检索出来发现好几个都是Denovo的,16s的要么就是数据样本少,不方便教循环、要么就是数据看起来一般,没啥代表性。所以我又下载了Denovo。不过这次视频有大约1小时时长,我一开始打算教30分钟完事的,看来还是拖了节奏。

接下来咋教

其实我也没有咋想过。我打算就让他入门就行了,至于后来怎么样就看他回国后的造化了,他确实运气不好,在我最忙的时候来中国找我学习。不过后面我们实验室的埃及老师也想跟我学生物信息学,我对她感觉还是很不错的,她学实验还是学的很快的。

一点感想

教留学生,我个人感觉还是很不错。至少让我多了很多教学经验吧,如何让完全不懂生物信息学的人入门生物信息学。以后争取尝试来个大规模的教学。不过可能要很久才能实现吧。

写在后面的
Shs还有大约一周就要走了,我也要尽力在一周内让他熟练最基本的宏基因组分析

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