重复序列挖掘
这次就写一个精简版本吧。毕竟程序经过了测试是成功的,可以挖掘基因组上任意长度的重复序列,但是目前还不完善。
挖掘重复序列的算法
利用一些数理逻辑的推理,采用遍历基因组算法,如果上端区域的序列在下端区域找不到,那么下端区域的序列也一定在上端区域找不到。话不多说,直接丢代码。(从代码语法就可以看出我并不是学perl起家的,满满的perl语法里一股R的味道)
后记
其实写这篇推文是想发泄一下最近一直在自己身上的负能量的。除了写程序,开发新方法自己可是一点实验都不会做。做出的结果还得指望女朋友来帮我做实验验证。也不知道自己都干了什么。已经无休假日均15小时工作了两个月了,本打算清明节也玩玩的,可是依然在工作,目测此状态将持续到暑假。真的是满满的负能量。
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